تعیین توالی DNA تکنیکی است که از دهه 70 درجهان آغاز شد و روشی برای شناسایی توالی بازهای موجود در ژنوم (A,T,C,G) ميباشد. تعيين توالي تشخيصی جهت تشخيص موتاسيون (جهش) و تعيين توالي تحقيقاتی معمولاً جهت شناسايي توالی ژنهای جدید مورد استفاده قرار ميگیرد.
معرفی روش Sanger sequencing
روش Sanger برگرفته از نام فردریک سنگر میباشد. این دانشمند برجسته برنده جایزه نوبل در سال 1958 برای شناسایی توالی اسید آمینه پروتئین و در سال 1980 برای تعیین توالی DNA است. در شکل زیر جزئیات این روش را ملاحظه میفرمایید:
روش کار :
در ابتدا با اضافه کردن "ddNTPs " واکنشهای تفکیک شده انجام میگردد. سپس در 4 ستون مختلف ژل، Gel running صورت میگیرد. در انتها توالیها از قسمت پایینی ژل خوانده میشوند: (قطعات کوتاهتر بدلیل سبک بودن از لحاظ جرم مولکولی در قسمتهای پایینی ژل قرار میگیرند)
در مرحله بعدی به منظور ردیابی محصولات واکنش، بایدآنها را با رادیواکتیو یا فلورسانس نشاندار کرد، در این مرحله محصولات نشاندار شده تحت تابش اشعه لیزر قرار میگیرند که در نهایت با آنالیز دستگاه sequencer ، نتایجی مشابه شکل زیر بدست میآید:
کیفیت گرافها و دقت نتایج بدست آمده، با چگونگی تهیه نمونه، ارتباط مستقیم دارد. نمودار فوق مربوط به نمونهایی است که طبق الگوی پیشنهادی تهیه شده است، همانطور که در شکل ملاحظه ميشود، تمامی پیکها کاملا واضح بوده و به درستی نوع بازهای آن تشخیص داده شده است. درحال حاضر معتبرترین شرکت سازنده دستگاههای Genetic Analyzer یا همان Sequencer فعالیت دارد Applied bioSyestems-ABI ميباشد. گروه ژنتیک کدون خدمات تعیین توالی به روش Sanger را بوسیله دستگاه 3500 Applied bioSyestems-ABI با بالاترن کیفیت ظرف مدت 3 تا 5 روز به محققان عزيز ارائه ميدهد.